Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDIT3P35638 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDIT3P35638 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDIT3P35638 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms