Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN2P35609 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN2P35609 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms