Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCK1P35558 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCK1P35558 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCK1P35558 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCK1P35558 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCK1P35558 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCK1P35558 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCK1P35558 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCK1P35558 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCK1P35558 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCK1P35558 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms