Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)16.17■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 STAU2-222ENST00000522962 1041 ntTSL 37.73□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.129e-10■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 510.61□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 210.24□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 410.07□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 48.75□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 27.72□□□□□ -1.173e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-211ENST00000519361 553 ntTSL 57.5□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 47.34□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 46.67□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 45.21□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.7□□□□□ -1.983e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 C5orf15-203ENST00000509913 487 ntTSL 318.19■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-9■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 C5orf15-202ENST00000507191 635 ntTSL 213.41□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.054e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.42e-9■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.274e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 PLPPR3-203ENST00000519502 782 ntTSL 227.35■■□□□ 1.974e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 38.2
GTF2F1P35269 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 38.1
GTF2F1P35269 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 522.66■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 38.1
GTF2F1P35269 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 38.1
GTF2F1P35269 MCM7-204ENST00000425308 1497 ntTSL 329.99■■■□□ 2.392e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 221.73■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 320.22■□□□□ 0.832e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 38
GTF2F1P35269 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 39□□□□□ -0.971e-19■■■■■ 38
GTF2F1P35269 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 38
GTF2F1P35269 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 410.39□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 38
GTF2F1P35269 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 38
GTF2F1P35269 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 218.72■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 38
GTF2F1P35269 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 520.29■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 38
GTF2F1P35269 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 510.47□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 320.04■□□□□ 0.87e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-206ENST00000437658 931 ntTSL 218.73■□□□□ 0.597e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 316.9■□□□□ 0.37e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 316.16■□□□□ 0.187e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 415.93■□□□□ 0.147e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-214ENST00000466975 560 ntTSL 414.75□□□□□ -0.057e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-205ENST00000417778 760 ntTSL 314.27□□□□□ -0.137e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-209ENST00000455226 585 ntTSL 413.02□□□□□ -0.337e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 312.93□□□□□ -0.347e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 412.91□□□□□ -0.347e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.397e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 312.38□□□□□ -0.437e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.317e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.657e-14■■■■■ 38
GTF2F1P35269 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 522.21■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 319.14■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 221.86■■□□□ 1.092e-9■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 218.4■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.497e-26■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.79□□□□□ -1.327e-26■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-221ENST00000546293 702 ntTSL 318.91■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 217.39■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-218ENST00000543868 507 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-220ENST00000544958 473 ntTSL 315.3■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 02e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-213ENST00000536993 315 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 EPHA2-204ENST00000480202 795 ntTSL 519.7■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 37.9
GTF2F1P35269 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 AC097376.2-203ENST00000608663 431 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 37.8
GTF2F1P35269 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 37.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 77.4 ms