Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NTF4P34130 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF4P34130 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTF4P34130 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF4P34130 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF4P34130 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF4P34130 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms