Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB3P28472 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms