Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX3P26022 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX3P26022 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX3P26022 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTX3P26022 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms