Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMPD1P23109 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms