Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPAP23025 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPAP23025 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPAP23025 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPAP23025 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPAP23025 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPAP23025 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPAP23025 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPAP23025 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPAP23025 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XPAP23025 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XPAP23025 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPAP23025 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPAP23025 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPAP23025 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPAP23025 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPAP23025 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPAP23025 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XPAP23025 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPAP23025 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms