Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT4P19013 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT4P19013 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT4P19013 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT4P19013 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT4P19013 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT4P19013 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT4P19013 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT4P19013 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms