Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF6P18850 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6P18850 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6P18850 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6P18850 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF6P18850 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF6P18850 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF6P18850 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATF6P18850 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF6P18850 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF6P18850 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF6P18850 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF6P18850 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF6P18850 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms