Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LBPP18428 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LBPP18428 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LBPP18428 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LBPP18428 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LBPP18428 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LBPP18428 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LBPP18428 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LBPP18428 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LBPP18428 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LBPP18428 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LBPP18428 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LBPP18428 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LBPP18428 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LBPP18428 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LBPP18428 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LBPP18428 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LBPP18428 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LBPP18428 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LBPP18428 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms