Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC2P18074 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC2P18074 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERCC2P18074 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms