Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB8P17481 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB8P17481 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB8P17481 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms