Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK4P11802 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK4P11802 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK4P11802 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK4P11802 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK4P11802 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK4P11802 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK4P11802 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK4P11802 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK4P11802 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK4P11802 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK4P11802 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK4P11802 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK4P11802 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK4P11802 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK4P11802 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK4P11802 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK4P11802 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK4P11802 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK4P11802 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK4P11802 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK4P11802 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK4P11802 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK4P11802 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK4P11802 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK4P11802 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK4P11802 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK4P11802 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms