Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD3P0DMS9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms