Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00032P0C843 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00032P0C843 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms