Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC172P0C7W6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms