Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47B1P0C2W7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms