Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLBP06746 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLBP06746 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLBP06746 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLBP06746 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLBP06746 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLBP06746 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLBP06746 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLBP06746 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLBP06746 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLBP06746 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms