Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGKV5-2P06315 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGKV5-2P06315 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGKV5-2P06315 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms