Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGF1P05230 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGF1P05230 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGF1P05230 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGF1P05230 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGF1P05230 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FGF1P05230 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGF1P05230 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGF1P05230 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGF1P05230 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGF1P05230 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGF1P05230 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGF1P05230 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGF1P05230 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGF1P05230 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGF1P05230 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGF1P05230 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGF1P05230 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGF1P05230 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGF1P05230 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGF1P05230 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGF1P05230 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGF1P05230 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms