Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRBV12-3P01733 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRBV12-3P01733 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms