Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR4O95473 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR4O95473 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms