Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UFL1O94874 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UFL1O94874 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UFL1O94874 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UFL1O94874 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UFL1O94874 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UFL1O94874 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UFL1O94874 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UFL1O94874 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UFL1O94874 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UFL1O94874 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UFL1O94874 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UFL1O94874 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UFL1O94874 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UFL1O94874 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UFL1O94874 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UFL1O94874 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UFL1O94874 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UFL1O94874 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UFL1O94874 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UFL1O94874 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UFL1O94874 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms