Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEBLO76041 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEBLO76041 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEBLO76041 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEBLO76041 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEBLO76041 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEBLO76041 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEBLO76041 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEBLO76041 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEBLO76041 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEBLO76041 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEBLO76041 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEBLO76041 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEBLO76041 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEBLO76041 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEBLO76041 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEBLO76041 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms