Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BBOX1O75936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BBOX1O75936 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBOX1O75936 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms