Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms