Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSDE1O75534 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSDE1O75534 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms