Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EDIL3O43854 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDIL3O43854 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDIL3O43854 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms