Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOPO43791 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOPO43791 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOPO43791 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPOPO43791 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOPO43791 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOPO43791 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOPO43791 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOPO43791 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOPO43791 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOPO43791 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPOPO43791 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms