Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TEAD4-204ENST00000443986 641 ntTSL 312.03□□□□□ -0.485e-10■■■■□ 26.5
PRPF4O43172 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 527.38■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 324.2■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 524.18■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 310.86□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 523.6■■□□□ 1.375e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 519.07■□□□□ 0.645e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 312.91□□□□□ -0.345e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 SAP130-205ENST00000450957 559 ntTSL 419.86■□□□□ 0.772e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 319.83■□□□□ 0.774e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 222.63■■□□□ 1.212e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 417.05■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 37.25□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 25.19□□□□□ -1.582e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 24.91□□□□□ -1.622e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 24.48□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 24.17□□□□□ -1.742e-7■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-205ENST00000506561 692 ntTSL 222.46■■□□□ 1.192e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 FAM20C-205ENST00000515795 2177 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.972e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-212ENST00000514698 2185 ntTSL 520.96■□□□□ 0.952e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 SQSTM1-210ENST00000506042 921 ntTSL 220.21■□□□□ 0.832e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-208ENST00000509948 796 ntTSL 319.72■□□□□ 0.752e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-203ENST00000502910 714 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 IDUA-204ENST00000504568 586 ntTSL 318.51■□□□□ 0.552e-8■■■■□ 26.4
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PRPF4O43172 SQSTM1-211ENST00000506690 2405 ntTSL 218.22■□□□□ 0.512e-8■■■■□ 26.4
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PRPF4O43172 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 211.55□□□□□ -0.562e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 GSDMB-209ENST00000479136 2209 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.662e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 GSDMB-211ENST00000519429 616 ntTSL 55.86□□□□□ -1.472e-8■■■■□ 26.4
PRPF4O43172 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 26.4
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PRPF4O43172 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-209ENST00000556094 785 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-204ENST00000342702 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-27■■■■□ 26.3
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PRPF4O43172 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-27■■■■□ 26.3
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PRPF4O43172 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-27■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WDR20-216ENST00000558567 586 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-27■■■■□ 26.3
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PRPF4O43172 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.945e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.655e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 517.79■□□□□ 0.445e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.325e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-14■■■■□ 26.3
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PRPF4O43172 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.255e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 316.59■□□□□ 0.255e-14■■■■□ 26.3
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PRPF4O43172 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.035e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MBD1-220ENST00000589758 385 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.215e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.439e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.319e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.29e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.38■■□□□ 1.179e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.049e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.939e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 HACD1-206ENST00000632169 1434 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.869e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-204ENST00000434216 891 ntTSL 220.41■□□□□ 0.861e-14■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.859e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.829e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 HACD1-203ENST00000466335 717 ntTSL 219.86■□□□□ 0.779e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.739e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.719e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 MAN2C1-223ENST00000565652 691 ntTSL 218.3■□□□□ 0.529e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.469e-8■■■■□ 26.3
PRPF4O43172 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-14■■■■□ 26.3
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