Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIP1O00291 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIP1O00291 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIP1O00291 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HIP1O00291 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIP1O00291 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIP1O00291 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIP1O00291 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIP1O00291 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIP1O00291 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HIP1O00291 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIP1O00291 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIP1O00291 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIP1O00291 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms