Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PMD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PMD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PMD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E9PMD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E9PMD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E9PMD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E9PMD0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E9PMD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PMD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PMD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PMD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PMD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PMD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PMD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PMD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PMD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PMD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PMD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PMD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PMD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PMD0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms