Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRBOX1C9JBD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRBOX1C9JBD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRBOX1C9JBD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRBOX1C9JBD0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRBOX1C9JBD0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRBOX1C9JBD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms