Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPBD1B2RD01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPBD1B2RD01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPBD1B2RD01 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms