Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms