Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOBPA7XYQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOBPA7XYQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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