Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NNZ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NNZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNZ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNZ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNZ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNZ2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNZ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNZ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms