Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LIPT2A6NK58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIPT2A6NK58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.9 ms