Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms