Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms