Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms