Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms