Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC149Q6ZUS6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms