Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL17Q6UXB2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL17Q6UXB2 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms