Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms