Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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VAMP3Q15836 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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