Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms