Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms